No hay una forma adecuada de verificar esto. Pero solo debes asegurarte de que solo descargas aplicaciones de confianza de la AppStore. Tampoco existe una aplicación secreta en iPhone o IOS, no es que haya oído hablar de una que haya usado IOS durante 7 años.
Siempre y cuando todas sus aplicaciones sean de AppStore y no descargue aplicaciones de terceros que no estén en la tienda, o la configuración de perfil instalada y encontrada en configuración> general> perfiles de Internet, ¡creo que debería estar seguro! Es mejor no tener ningún perfil instalado, ya que hubo un malware a principios de este año que infectó los dispositivos IOS después de que se instaló el perfil, lo que hizo que se bloquee y se congele.
Sin embargo, si no se siente cómodo y quiere asegurarse de tener un firmware IOS nuevo y limpio en su iPhone, simplemente puede restaurarlo a la configuración de fábrica conectando su dispositivo en iTunes y reinstalar las aplicaciones manualmente desde la AppStore que es el más seguro y limpio en lugar de restaurar desde una copia de seguridad, tenga en cuenta que sus datos se borrarán.
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Estos son mis consejos. En general, IOS es bastante seguro y su teléfono debería estar bien a menos que note alguna actividad extraña que es bastante poco común en IOS.