Javascript y PHP tienen roles completamente diferentes, por lo que su pregunta no tiene mucho sentido, déjenme explicar:
PHP se usa para el back-end, puede usarlo para comunicarse con una base de datos y generar una página estática a partir de una plantilla.
Javascript se usa para el front-end (también se puede usar para el back-end, pero lo dejaremos de lado), puede usarlo para cambiar la página después de que se cargó (respuesta a los clics del usuario, etc.).
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Python puede “reemplazar” PHP y ser un lenguaje de back-end, puede generar páginas HTML y comunicarse con una base de datos; para este python es una muy buena opción, le sugiero que comience con el matraz, es un marco simple.
También puedes usar Python en el front-end, pero no lo hagas, usamos Javascript para eso, vamos a mantenerlo así …