No lo hará. Sospecho que WhatsApp será obsoleto antes de que los SMS se vuelvan obsoletos.
La belleza de los SMS radica en el hecho de que es independiente de la red. Puede enviar mensajes de texto a cualquier persona, en cualquier país, utilizando cualquier operador. Hay decenas de miles de operadores en todo el mundo que, de una forma u otra, están interconectados.
Hasta que podamos lograr esa misma penetración utilizando otros medios, los SMS no desaparecerán.
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De hecho, el tráfico de SMS continúa creciendo año tras año, y parte de ese crecimiento se debe a las aplicaciones A2P como la autenticación, validación y verificación de dos factores.
Para responder con mayor precisión a su pregunta, en el escenario poco probable de que desaparezca un SMS, tendrá que ser reemplazado por algo que tenga una penetración similar, el único producto actual que se me ocurre, que tiene una penetración similar es Facebook; en ese caso, veremos algo similar a lo que vimos con los servicios de autenticación y las tecnologías de inicio de sesión único.