¿Tercera parte? No. Existe un proyecto de código abierto llamado GNU Octave para el que es más probable que encuentre software de terceros, pero MATLAB se puede llamar desde C al menos. Estoy seguro de que puede encontrar proyectos útiles que llaman a MATLAB desde un programa en C.
La razón por la que en gran parte no hay ningún software de terceros escrito en el script MATLAB en sí mismo es porque hay muchas funciones que son tan poderosas y fáciles de combinar y específicas para el problema que está buscando resolver, por lo general no hace tiene sentido escribir algo para usar una y otra vez, porque MATLAB ya lo tiene, o sería tan básico que parece una tontería.
Además, los complementos proporcionados por los proveedores de hardware externo y tareas muy específicas se pueden comprar desde MATLAB. Entonces, en muchos casos tampoco tiene sentido escribir una herramienta como esta, porque ya existe y funciona muy bien. Todo lo que tienes que hacer es comprarlo.
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